MetNormalizer — 使用独立归一化流程

文档核对版本: 1.3.02 · 2026-09-23

MetNormalizer 是官网包目录列出的独立 QC 归一化工具,其文件式 metNor() 接口不同于 masscleaner::normalize_data()。必须准备对应格式,不能直接把它替换进 mass_dataset 流程。

按包示例准备 MS1 表和样品信息 CSV,包含所需 QC 与采集信息。在独立目录中检查过滤比例和优化参数,运行后查看归一化数据与诊断结果,保留原始输入和设置。

当前接口中 multiple = 1 使用基于进样顺序的 SVR,更大的值使用相关峰,应根据采集与研究设计选择。新的对象式 TidyMass 流程通常可以直接采用 masscleaner 的归一化入口。

功能范围

输入校验与独立的 QC/SVR 归一化流程。

使用示例

# Requires MetNormalizer-format CSV files in normalization_input/.
# MetNormalizer::metNor(
#   ms1.data.name = "data.csv",
#   sample.info.name = "sample.info.csv",
#   path = "normalization_input", optimization = TRUE,
#   multiple = 1, threads = 2
# )
help("metNor", package = "MetNormalizer")

函数查询

下面列出已核对源码中导出的 API,包括兼容接口与辅助函数。具体参数以安装版本的 R 帮助为准;例如运行 help("函数名", package = "MetNormalizer")

展开导出函数列表

MetNormalizer_logo, checkData, metNor

包源码与参考文档 · 完整工作流

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