R shiny 使用说明

通过浏览器界面完成 LC-MS 数据处理与分析。本教程针对独立的 tidymassshiny 应用；桌面软件中的 Shiny tools 安装器请看 macOS/Windows 教程。

公开源码当前标记为 tidymassshiny 1.0.0。在线服务和 Docker 镜像可能使用不同构建，运行时请记录实际版本。

1. 安装与访问 R Shiny
2. 创建项目与导入数据
3. 质量评估与数据清洗
4. 注释、统计与富集
5. fMSEA、FPA 与数据库工具
6. 保存结果与常见问题

应用源码 · 原版完整教程

图解：本章操作路线

按顶部导航从项目初始化进入下游分析，尽早保存项目位置或在线 JOB ID。正负离子模式具有独立视图；阅读表格或图形前先确认当前极性。

看图操作：初始化 Shiny 项目

1. 打开 Initialize project，选择 R 进程可访问的工作目录，并在导入前命名研究。
2. 确认初始化完成，再从 Data import 选择输入路线；不同分析使用不同项目。