使用本机运行的 TidyMass Desktop 完成 LC-MS 数据处理与分析。教程保留英文按钮名，便于对照软件界面。按安装 → 输入 → 完整工作流阅读，之后按需查阅各工具。
macOS Apple Silicon 0.1.65 — 预览版，更新日期：2026-09-23。平台版本分别维护，不能以另一平台的新功能推断本版本支持。
- 安装与快速开始
- 输入数据与样品信息
- 完整非靶向代谢组学工作流
- 参数试跑、任务中心与 workflow 模板
- Feature 审查与交互图
- Analysis tools：独立分析工具
- Shiny tools 与 R environment
- 导出、项目保存与恢复
- 常见问题
图解：本章操作路线
完整分析使用 Workflows，单项任务使用 Analysis tools。项目保存运行记录与输出。先用小型代表性数据熟悉界面，再为完整研究创建独立项目。
看图操作：阅读已保存的流程结果
- 先看左侧阶段列表：当前选中 Data exploration；Data cleaning 标记为 Stale，表示上游输入已改变。Blocked 阶段尚无可用的前置输入。
- 在 Displayed dataset 核对运行标识、Samples、Features 和 Missing values。图中 24 个矩阵单元中有 7 个缺失，即 29.17%；这不是整份缺失样本的比例。
- 选择已保存运行，展开 Settings used for this result。比较两份结果前确认它们的输入和参数能够回答同一问题。
- 复核后按顺序重跑过期的下游阶段；若失败，先检查第一条错误再调整参数或重试。