构建公共数据库

sessionInfo()
#> R version 4.4.1 (2024-06-14)
#> Platform: aarch64-apple-darwin20
#> Running under: macOS 15.0
#> 
#> Matrix products: default
#> BLAS:   /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.4-arm64/Resources/lib/libRblas.0.dylib 
#> LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.4-arm64/Resources/lib/libRlapack.dylib;  LAPACK version 3.12.0
#> 
#> locale:
#> [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
#> 
#> time zone: Asia/Singapore
#> tzcode source: internal
#> 
#> attached base packages:
#> [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
#> 
#> loaded via a namespace (and not attached):
#>  [1] digest_0.6.37     R6_2.5.1          bookdown_0.40     fastmap_1.2.0    
#>  [5] xfun_0.47         blogdown_1.19     cachem_1.1.0      knitr_1.48       
#>  [9] htmltools_0.5.8.1 rmarkdown_2.28    lifecycle_1.0.4   cli_3.6.3        
#> [13] sass_0.4.9        jquerylib_0.1.4   compiler_4.4.1    rprojroot_2.0.4  
#> [17] here_1.0.1        rstudioapi_0.16.0 tools_4.4.1       evaluate_0.24.0  
#> [21] bslib_0.8.0       yaml_2.3.10       jsonlite_1.8.8    rlang_1.1.4

构建公共数据库

来自 Michael Snyder 实验室 的内部 MS2 数据库

1. Michael Snyder HILIC 数据库

2. Michael Snyder RPLC 数据库

来自 Caroline Johnson 实验室 的内部 MS2 数据库

1. Caroline Johnson HILIC 数据库

2. Caroline Johnson RPLC 数据库

公共 MS2 数据库

1. HMDB 数据库

2. MassBank 数据库

3. MoNA 数据库

4. Orbitrap 数据库

5. Fiehn HILIC 数据库

公共 MS1 数据库

1. HMDB MS1 数据库

2. KEGG MS1 数据库

3. T3DB 数据库

4. 血液暴露组数据库

会话信息

来自 Michael Snyder 实验室的内部 MS2 数据库

来自 Caroline Johnson 实验室的内部 MS2 数据库